产品名称:
丙型流感病毒检测试剂盒(实时荧光PCR法)
2.复性(退火)和延伸温度
将PCR反应所需的成分配置完后,在PCR仪上于94-96℃预加热几十秒至几分钟,使模板DNA充分变性,然后进入扩增循环。在每一个循环中,先于94℃保持30秒钟使模板变性,然后将温度降到复性温度(一般50-60℃之间),一般保持30秒钟,使引物与模板充分退火;在72℃保持1分钟(扩增1kb片段),使引物在模板上延伸,合成DNA,完成一个循环。重复这样的循环25~35次,使扩增的DNA片段大量累积。*后,在72℃保持3-7min,使产物延伸完整,4℃保存。
1.常规程序
复性的温度是PCR扩增是否顺利的关键因素,通常在50-60℃之间。具体的温度主要由引物的Tm值决定。延伸温度绝大多数设定为72℃。如果复性的温度很高,可以将延伸温度和复性温度设置成同一温度,变成二步法PCR。
3.反应时间
变性步骤一般使用30秒钟,如果模板的G+C含量较高,或直接用细胞做模板,变性时间可适当延长。复性时间有30秒种一般是足够的。延伸时间由扩增产物的大小决定,一般采用1kb用1分钟来保证充足的时间。
4.循环次数
循环次数主要与模板的起始数量有关,在模板拷贝数为104~105数量级时,循环数通常为25~35次。
平台效应(plateaueffect):PCR扩增过程后期会出现的产物的积累按减弱的指数速率增长的现象。原因:底物和引物的浓度已经降低,dNTP和DNA聚合酶的稳定性或活性降低,产生的焦磷酸会出现末端产物抑制作用,非特异性产物或引物的二聚体出现非特异性竞争作用,扩增产物自身复性,高浓度扩增产物变性不彻底。
5.PCR反应液的配制
PCR反应体系的配置方式有时也会影响反应的正常进行。常规方法与其它酶学反应一样,在*后加入DNA聚合酶。早期的PCR仪没有带加热的盖子,要求在反应液上覆盖一层矿物油,防止水分蒸发。
对于使用具3’-5’外切活性的高温DNA聚合酶时,有时会扩增不出产物。在遇到这个问题时,如果将反应成分分开配制,A管含模板、引物和dNTP,以及调整体积的H2O,B管含缓冲液、DNA聚合酶和水,然后再将两管溶液混合起来,可较好地克服这个问题。
按照常规的方法配制反应体系,有时会出现非特异性扩增的问题。热启动(hotstart)PCR操作方式可较好解决这一问题。将dNTP、缓冲液,Mg2+和primer先配制好,然后加入一粒蜡珠(如AmpliWaxPCRQam100),加热熔化,再冷却,使蜡将溶液封住,*后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有当PCR反应进入高温阶段后,蜡层熔化,所有反应成分才会混合在一起。
丙型流感病毒检测试剂盒(实时荧光PCR法)
【使用方法】
1. 样品处理(样本处理区)
1.1 样本前处理
组织:取50mg左右组织用玻璃匀浆器匀浆,匀浆后置入洁净的1.5ml离心管中;
液体标本:取适量标本13000rpm离心2min,弃上清。
1.2 DNA提取
1) 对上述处理好的标本加入40ul 核酸提取液,100℃恒温处理10分钟,13,000 rpm离心5分钟,取上清液转移至新的1.5ml EP管,-20℃保存;
2) DNA的提取也可以采用北京亿森宝公司生产的DNA提取试剂盒(离心柱提取法),请严格按照试剂盒说明书进行操作。
2. 试剂配制(试剂准备区)
根据代检测样本总数,设所需要的PCR反应管管数为N(N=样本数+1
管阴性对照+1管阳性对照),体系配制如下表:
试剂
WSSV 反应液
酶液
用量(样本数为N)
20μl
1μl
3. 加样(样本处理区)
将步骤1提取的DNA、阳性质控品、阴性质控品各取4μl,加入相应的
反应管中,盖好管盖,混匀,短暂离心。
4. PCR扩增(核酸扩增区)
4.1 将待检测反应管置于荧光定量PCR仪反应槽内;
5. 结果分析判定
结果分析条件设定
设置基线(baseline):一般情况下,对ABI 7500、7700等仪器设为6-15cycle,对PE5700设为3-15cycle,对MJ Research Option2设为6-12cycle。特殊情况可对基线适当调整。
设置阈值(threshold):以阈值线刚超过阴性对照扩增曲线(无规则的噪音线)的zui高点。
结果判断
阳性:检测样本Ct值小于等于35.0,且曲线有明显的指数增长期;
可疑:检测样本Ct值大于35.0且小于40.0,重复一次实验,如果Ct值仍小于40.0,且曲线有明显的指数增长期,为阳性,否则为阴性;
阴性:检测不到样本Ct值或Ct值为40。
6. 对检验结果的解析
实验室环境污染,试剂污染,标本交叉污染会出现假阳性结果;试剂运输,保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降,出现假阴性或定量检测不准确的结果。
7. 质控标准
阴性质控品:扩增曲线无对数生长期或无Ct值显示;
阳性质控品:扩增曲线有明显对数生长期,且Ct值≤32;
以上条件应同时满足,否则实验视为无效。