标准菌株：亦称模式菌株，由国内或国际菌种保藏机构保藏的，遗传学特性得到确认和保证和保证并可追遡的菌株。标准菌株的复活或培养物的制备应按照供应商提供的说明或按已验证的方法进行。

   在给某细菌定名，分类作记载和发表时，为了使名准确和作为分类概念的准则，以纯粹活菌可繁殖状态所保存的菌种。相当于动植物分类中的模式标本。在进行细菌等的分类和鉴定时，生理学和生物化学特性十分重要，但若就这些性质进行试验，就必须应用许多纯分离的新细胞。因此，作为分类标准的菌种，也有必要进行纯粹分离，并以活菌可以分裂状态保存。

   在标准菌种中，对于从作过原始记载的作者实际分离或应用的菌株，通过营养繁殖获得和保存的菌株，称为正标准菌株。此外当原作者使用复数菌株，以后的研究者选择其中之一作为最适当的菌株时，称该菌种为选定标准菌株。当原作者使用的菌株失掉，以后的研究都就新的菌株研究，记载后，确认可以作为国际上正标准菌株的代替菌株时，称该菌株为新模式菌株。保存菌种时，必须留心不使菌株在保存过程中死亡或发生变异。